ทุกคลาสหน้าต่างต้องใช้หมายเลขอ้างอิงอินสแตนซ์เพื่อระบุโปรแกรมประยุกต์หรือ DLL ที่ลงทะเบียนเรียน ระบบจะต้องจับอินสแตนซ์การติดตามทั้งหมดของโมดูล ระบบการจัดการที่กำหนดให้กับแต่ละสำเนาของปฏิบัติการรันหรือ DLL.
ระบบหมายเลขอ้างอิงการอินสแตนซ์ที่ส่งผ่านไปยังฟังก์ชันจุดของปฏิบัติการแต่ละ (ดูที่WinMain) และ DLL (ดู DllMain) การปฏิบัติหรือการกำหนด DLL อินสแตนซ์นี้จัดการการเรียน โดยการคัดลอกไปยังสมาชิกhInstanceของโครงสร้างWNDCLASSEX.
Windows 95 และ Windows 98: หลายอินสแตนซ์ของแอพลิเคชันหรือ DLL เดียวกันใช้รหัสเซกเมนต์เดียวกัน แต่ละมีเซ็กเมนต์ข้อมูลของตนเอง ระบบใช้หมายเลขอ้างอิงการอินสแตนซ์เพื่อระบุเซ็กเมนต์ข้อมูลที่สอดคล้องกับอินสแตนซ์ที่เฉพาะของโปรแกรมประยุกต์หรือ DLL.